台灣位於亞熱帶，是尿路結石好發地區，流行病學研究顯示，在台灣大約每十個人就有一人是結石患者，尤其在夏天，由於氣溫高、流汗多、尿量少造成尿液濃縮，尿液中各種礦物質濃度升高，容易結晶產生結石，因此每年到了夏天，泌尿科門診總是排滿了結石的患者。
根據結石的位置，尿路結石可以分為上泌尿道結石（腎結石、輸尿管結石）及下泌尿道結石（膀胱結石）。上泌尿道結石主要是病患的體質（代謝、尿路結構）加上後天種種不利的因素（不適當的喝水、飲食、生活習慣）造成尿液中礦物質在腎臟中形成結晶形成腎結石，當結石掉到輸尿管，便稱為輸尿管結石。不同於上泌尿道結石，膀胱結石通常是因為病患本身有排尿障礙，例如攝護腺肥大或神經性膀胱，尿液中礦物質在膀胱中結晶形成結石。
各位置的結石在治療上不盡相同，本文章介紹腎結石的治療，輸尿管結石將在其他文章中介紹。而膀胱結石主要屬於攝護腺肥大的領域，需同時治療攝護腺肥大。
目前腎結石的外科治療，幾乎都是以微創手術或無傷口的方式進行，主要有下列三種：
（一）體外震波碎石
體外震波碎石術是利用電磁場（electromagnetic）或電擊（electrohydraulic）產生攜帶能量的震波，藉由水及身體組織傳導，將能量匯聚在結石上，將石頭震碎成碎片，而這些碎片會隨著尿流排出體外。這項技術發明於1980年代，迄今已經是相當成熟的治療，由於整個過程是沒有傷口的，是治療腎結石侵入性最低的手術方式。大多數的震波碎石治療不需要住院，約需時50分鐘，完成治療後若無不適即可離院，術後需配合藥物治療及大量飲水，促進碎石排出。雖然震波治療較其他手術方式方便，並不是所有的病患都適用於這個手術：對於較大（大於兩公分）或較硬結石，單次震波可能無法將石頭震碎，有時候需第二次震波治療，或改用其他手術治療；對於體型較大的患者，震波可能被身體組織所吸收，剩餘能量不足以將石頭震碎；位於下腎盞或某些特殊的腎臟結構也可能導致震波的效果不佳；此外，孕婦、凝血功能異常、或有感染發燒的病患是不能接受體外震波碎石手術的。若有服用抗凝血劑的患者，需停藥一週才能接受這項治療。整體而言，震波的成功率約八成，由於其低侵入性的特質，目前是大多數結石的第一線治療。
（二）經皮穿腎取石手術
經皮穿腎取石手術發明於1970年代，迄今已達四十年，已經是一項成熟的手術。藉由超音波或Ｘ光機定位的方式，在病患背側開一個約１公分的小傷口，經由這個傷口建立一個通道直達腎臟裡面，將石頭以碎石器或雷射打成碎片後取出。目前對於大於兩公分的石頭，經皮穿腎取石手術仍被視為治療的首選，相較於傳統動輒十幾公分的開腹手術，這項手術傷口很小，術後恢復也很快，手術完約一至二天即可出院。隨著科技及手術器材的發展，傳統經皮穿腎取石手術也有進步：（１）搭配軟式輸尿管鏡的使用，可以使手術進行更順利，同時增加結石的廓清率；（２）對於較小的石頭，可採用迷你經皮穿腎取石術（傷口小於0.5公分）；（３）搭配止血凝膠的使用，術後可以不用放置腎造廔管，減少術後疼痛。總結而言，經皮穿腎取石手術主要用於處理較大及較硬的石頭，是目前處理大量結石最有效率的方式。
（三）軟式輸尿管鏡
光纖技術的進步推動了軟式輸尿管鏡的發展，這種「可轉彎」的內視鏡可以由尿道口進入體內，經由膀胱及輸尿管，一路上行至腎臟內，搭配雷射將石頭打成碎片。軟式輸尿管鏡碎石手術屬於較新的手術方式，其興起約莫是近十年的事，隨著軟式內視鏡、影視系統、雷射碎石儀器進步，這項技術已趨成熟，取代了部分的經皮穿腎取石術及體外震波碎石手術。相較於經皮穿腎取石術，軟式輸尿管鏡手術的優勢在於：（１）無傷口（２）出血量極少（３）術後復原快。雖然有上述優點，軟式輸尿管鏡並非適用於所有的情況，對於太大的石頭，軟式輸尿管鏡處理的時間會比較久，目前泌尿醫學界的共識是，對於小於２公分的結石，可以優先考慮軟式輸尿管鏡手術或體外震波碎石手術；而大於2公分的結石，單次軟式輸尿管鏡手術的成功率較低，仍應優先考慮經皮穿腎取石手術。
目前結石的手術治療已經非常成熟，幾乎所有的結石都能採用微創手術或甚至無傷口手術的方式處理，建議諮詢專業的泌尿科醫師，找尋最適當的治療方式。